In case it is useful or interesting to anyone, here is a diff of the LibSrc directory between the different versions of Clarion.
Note: The builds used in the comparison are different but I think still close enough for this comparison.
tl;dr The EE version has a bunch of files that are not in the PE version 
Professional Edition (12463)
Enterprise Edition (12258)
abapi.clw
abapi.clw
abapi.inc
abapi.inc
ABASCII.CLW
ABASCII.CLW
ABASCII.INC
ABASCII.INC
abbreak.clw
abbreak.clw
abbreak.inc
abbreak.inc
abbrowse.clw
abbrowse.clw
ABBROWSE.EQU
ABBROWSE.EQU
ABBROWSE.INC
ABBROWSE.INC
ABBROWSE.TRN
ABBROWSE.TRN
abcpthd.clw
abcpthd.clw
abcpthd.inc
abcpthd.inc
ABDOCK.CLW
ABDOCK.INC
abdrops.clw
abdrops.clw
ABDROPS.INC
ABDROPS.INC
abdst.clw
abdst.clw
abdst.inc
abdst.inc
abdst.trn
abdst.trn
ABEIP.CLW
ABEIP.CLW
ABEIP.INC
ABEIP.INC
ABEIP.TRN
ABEIP.TRN
ABERROR.CLW
ABERROR.CLW
ABERROR.INC
ABERROR.INC
ABERROR.TRN
ABERROR.TRN
ABFILE.CLW
ABFILE.CLW
ABFILE.EQU
ABFILE.EQU
ABFILE.INC
ABFILE.INC
abfuzzy.clw
abfuzzy.clw
abfuzzy.inc
abfuzzy.inc
abgrid.clw
abgrid.clw
abgrid.inc
abgrid.inc
ABLINKP.CLW
ablinkp.inc
abllist.int
ABLPROP.CLW
ABLPROP.INC
ABLPROP.INT
ABLPROPR.CLW
ABLPROPR.INC
ABLSYM.CLW
ABLSYM.INC
ABLWIN.CLW
ABLWIN.INC
ablwinr.clw
ABLWINR.INC
ablwman.CLW
ablwman.inc
ABLWMAN.INT
ablwman.trn
abmime.clw
abmime.clw
abmime.inc
abmime.inc
ABPOPUP.CLW
ABPOPUP.CLW
ABPOPUP.INC
ABPOPUP.INC
ABPOPUP.TRN
ABPOPUP.TRN
abprhtml.clw
ABPRHTML.INC
abprname.clw
abprname.clw
abprname.inc
abprname.inc
abprpdf.clw
ABPRPDF.INC
abprtarg.clw
abprtarg.clw
abprtarg.inc
abprtarg.inc
abprtarg.int
abprtarg.int
abprtary.clw
abprtary.inc
abprtext.clw
abprtext.inc
abprxml.clw
abprxml.clw
abprxml.inc
abprxml.inc
abqeip.clw
abqeip.clw
abqeip.inc
abqeip.inc
abquery.clw
abquery.clw
ABQUERY.INC
ABQUERY.INC
ABQUERY.TRN
ABQUERY.TRN
ABREPORT.CLW
ABREPORT.CLW
ABREPORT.INC
ABREPORT.INC
ABREPORT.TRN
ABREPORT.TRN
ABRESIZE.CLW
ABRESIZE.CLW
ABRESIZE.EQU
ABRESIZE.EQU
ABRESIZE.INC
ABRESIZE.INC
abrpatmg.clw
abrpatmg.clw
abrpatmg.equ
abrpatmg.equ
abrpatmg.inc
abrpatmg.inc
abrppsel.clw
abrppsel.clw
abrppsel.inc
abrppsel.inc
ABRPTGEN.INT
ABRPTGEN.INT
abrule.clw
abrule.clw
abrule.inc
abrule.inc
absql.clw
absql.inc
ABTblSyn.CLW
ABTblSyn.INC
ABTOOLBA.CLW
ABTOOLBA.CLW
ABTOOLBA.EQU
ABTOOLBA.EQU
ABTOOLBA.INC
ABTOOLBA.INC
ABTOOLBA.TRN
ABTOOLBA.TRN
ABUserControl.CLW
ABUserControl.CLW
ABUserControl.INC
ABUserControl.INC
ABUTIL.CLW
ABUTIL.CLW
ABUTIL.INC
ABUTIL.INC
ABUTIL.TRN
ABUTIL.TRN
abutilui.inc
abutilui.inc
ABVCRFRM.CLW
ABVCRFRM.CLW
abvcrfrm.inc
abvcrfrm.inc
ABWINDOW.CLW
ABWINDOW.CLW
ABWINDOW.INC
ABWINDOW.INC
ABWMFPAR.CLW
ABWMFPAR.CLW
ABWMFPAR.EQU
ABWMFPAR.EQU
ABWMFPAR.INC
ABWMFPAR.INC
abwsock.clw
abwsock.clw
abwsock.inc
abwsock.inc
ActiveImage.clw
ActiveImage.clw
ActiveImage.inc
ActiveImage.inc
adoint.inc
adoint.inc
adoprcs.clw
adoprcs.clw
adoprcs.inc
adoprcs.inc
adoprocc.clw
adoprocc.clw
adoprocc.inc
adoprocc.inc
ado_sql.int
ado_sql.int
brwext.clw
brwext.clw
brwext.inc
brwext.inc
brwext.trn
brwext.trn
builtins.clw
builtins.clw
busmath.pr
busmath.pr
c60cr8.inc
c60cr8.inc
c60cr8l.inc
c60cr8l.inc
cbrowse.clw
cbrowse.clw
cbrowse.inc
cbrowse.inc
cfiltbase.clw
cfiltbase.clw
cfiltbase.inc
cfiltbase.inc
cfilterlist.clw
cfilterlist.clw
cfilterlist.inc
cfilterlist.inc
cfilterlist.trn
cfilterlist.trn
cFldPair.clw
cFldPair.clw
cFldPair.inc
cFldPair.inc
ClaAwsS3.clw
ClaAwsS3.inc
clacvtdrv.clw
clacvtdrv.clw
CLACVT__.CLW
CLACVT__.CLW
CLACVT__.INC
CLACVT__.INC
ClaMail.CLW
ClaMail.CLW
ClaMail.INC
ClaMail.INC
ClaRunExt.CLW
ClaRunExt.CLW
ClaRunExt.INC
ClaRunExt.INC
clawstd.exp
clawstd.exp
CLIB.CLW
CLIB.CLW
cpxml.clw
cpxml.clw
cpxml.inc
cpxml.inc
cpxmlif.inc
cpxmlif.inc
CSIDL.EQU
CSIDL.EQU
CSIDLFolder.clw
CSIDLFolder.clw
CSIDLFolder.inc
CSIDLFolder.inc
cwado.clw
cwado.clw
cwado.inc
cwado.inc
CWCR8.INC
CWCR8.INC
cwcr8l.inc
cwcr8l.inc
cwexcpt.int
cwexcpt.int
cwfinpro.clw
CWHELP.INT
CWHELP.INT
cwhh.inc
cwhh.inc
CWINT.INT
CWINT.INT
CWSTATDT.CLW
CWSTATDT.CLW
cwstatpr.clw
cwstatpr.clw
cwsynch.int
cwsynch.int
cwsynchc.clw
cwsynchc.clw
cwsynchc.inc
cwsynchc.inc
cwsynchm.inc
cwsynchm.inc
CWSYNCLP.CLW
CWSYNCWT.CLW
CWSYNCWT.INC
CWTOUCH.CLW
CWTOUCH.CLW
CWTOUCH.INC
CWTOUCH.INC
CWTOUCHDEF.INC
CWTOUCHDEF.INC
CWUTIL.CLW
CWUTIL.CLW
CWUTIL.INC
CWUTIL.INC
CWUtilEquates.inc
CWUtilEquates.inc
DDE.CLW
DDE.CLW
DEFAULTS.CLW
DEFAULTS.CLW
DynFile.clw
DynFile.inc
dynstr.inc
dynstr.inc
EFOCUS.CLW
EFOCUS.CLW
EFOCUS.INC
EFOCUS.INC
equates.clw
equates.clw
ERRORS.CLW
ERRORS.CLW
filecb.inc
filecb.inc
fileWrap.clw
fileWrap.clw
GroupWrap.clw
GroupWrap.clw
H5BROKER.CLW
H5BROKER.INC
H5CLIENT.CLW
H5CLIENT.INC
H5CNTRLS.CLW
H5CNTRLS.INC
H5EVENT.CLW
H5EVENT.INC
H5FILES.CLW
H5FILES.INC
H5HTML.CLW
H5HTML.INC
H5HTTP.CLW
H5HTTP.INC
H5JSL.CLW
H5JSL.INC
H5LAYOUT.CLW
H5LAYOUT.INC
H5REPORT.CLW
H5REPORT.INC
H5REPORT.TRN
H5SERVER.CLW
H5SERVER.INC
H5SERVER.TRN
H5SINK.INC
H5STD.CLW
H5STD.EQU
H5STD.INC
H5TXTOUT.CLW
H5TXTOUT.INC
H5UNAUTH.HTM
H5WINDOW.CLW
H5WINDOW.INC
H5WINDOW.TRN
i64.INC
i64.INC
ibarray.clw
ibarray.inc
ibarray.int
IBASE.INC
ibcbase.CLW
ibcbase.cpp
ibcbase.INC
ibcbase.INT
iblob.inc
iblob.inc
ICBROKER.CLW
ICBROKER.INC
ICCLIENT.CLW
ICCLIENT.INC
ICCNTRLS.CLW
ICCNTRLS.INC
ICEVENT.CLW
ICEVENT.INC
ICFILES.CLW
ICFILES.INC
ICHTML.CLW
ICHTML.INC
ICHTTP.CLW
ICHTTP.INC
icjsl.CLW
ICJSL.INC
ICLAYOUT.CLW
ICLAYOUT.INC
ICREPORT.CLW
ICREPORT.INC
ICREPORT.TRN
ICSERVER.CLW
ICSERVER.INC
ICSERVER.TRN
ICSINK.INC
ICSTD.CLW
icstd.equ
ICSTD.INC
ICTXTOUT.CLW
ICTXTOUT.INC
ICUNAUTH.HTM
ICWINDOW.CLW
ICWINDOW.INC
ICWINDOW.TRN
idoc.inc
idoc.inc
idocft.inc
idocft.inc
ifilter.int
ifilter.int
ipexten.clw
ipexten.inc
ISystemFolder.inc
ISystemFolder.inc
itrans.int
itrans.int
JSON.CLW
JSON.INC
KEYCODES.CLW
KEYCODES.CLW
LastChanceHook.CLW
laybuild.int
layhtml.int
LAYIFACE.INT
laylist.int
layout.int
layskel.int
layvalue.int
mdisync.clw
mdisync.clw
mdisync.inc
mdisync.inc
MENUStyle.CLW
MENUStyle.CLW
MENUStyle.INC
MENUStyle.INC
OCX.CLW
OCX.CLW
OCXEVENT.CLW
OCXEVENT.CLW
ODBCATTR.INC
ODBCATTR.INC
PRNPROP.CLW
PRNPROP.CLW
PROFILE.CLW
PROFILE.CLW
property.clw
property.clw
qprocess.clw
qprocess.clw
qprocess.inc
qprocess.inc
queueWrap.clw
queueWrap.clw
QuickSock.CLW
QuickSock.INC
QuickSocket.CLW
QuickSocket.INC
QuickXMLParser.clw
QuickXMLParser.clw
QuickXMLParser.inc
QuickXMLParser.inc
RESCODE.CLW
RESCODE.CLW
RESDEF.CLW
RESDEF.CLW
rtf.int
rtf.int
rtfctl.clw
rtfctl.clw
rtfctl.inc
rtfctl.inc
RWPRLIB.INC
RWPRLIB.INC
SpecialFolder.clw
SpecialFolder.clw
SpecialFolder.inc
SpecialFolder.inc
svado.clw
svado.clw
svado.inc
svado.inc
svapi.inc
svapi.inc
svapifnc.inc
svapifnc.inc
svbase.clw
svbase.clw
svbase.inc
svbase.inc
svcom.clw
svcom.clw
svcom.inc
svcom.inc
svcomdef.inc
svcomdef.inc
svdate.clw
svdate.clw
svdate.inc
svdate.inc
svgraph.clw
svgraph.equ
svgraph.inc
svgraphb.inc
svhelper.clw
svhelper.clw
svhelper.inc
svhelper.inc
svmapper.clw
svmapper.clw
svmapper.inc
svmapper.inc
SystemString.clw
SystemString.clw
SystemString.inc
SystemString.inc
TPLEQU.CLW
TPLEQU.CLW
TreeViewWrap.clw
TreeViewWrap.clw
trigger.clw
trigger.clw
trigger.inc
trigger.inc
ViewWrap.clw
ViewWrap.clw
wbbroker.CLW
wbbroker.inc
wbclienb.inc
wbclient.CLW
wbclient.inc
wbdummy.htm
WBFILE.CLW
WBFILE.inc
wbfiles.clw
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WBFRAME.CLW
WBFRAME.INC
wbguard.clw
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wbguard.trn
wbhits.clw
wbhits.inc
WBHOOK.CLW
WBHOOK.INC
WBHOOK.TRN
wbhtml.clw
wbhtml.inc
wbhtmlc.clw
wbhtmlc.inc
wbhttp.CLW
wbhttp.inc
wbhttp.int
wbhttpb.inc
WBJSL.CLW
WBJSL.INC
wbpdfpreview.clw
wbpdfpreview.inc
wbpreview.clw
wbpreview.inc
wbreport.CLW
wbreport.inc
wbreport.TRN
wbserver.clw
wbserver.inc
wbserver.TRN
wbsink.inc
wbstd.CLW
wbstd.equ
wbstd.inc
WBSTD2.CLW
wbstd2.inc
wbtxtout.CLW
wbtxtout.inc
wbunauth.htm
wbutil.clw
wbutil.inc
wbvisit.clw
wbvisit.inc
windows.inc
windows.inc
winerr.inc
winerr.inc
winext.clw
winext.clw
winext.inc
winext.inc
WINSOCK.INC
WINSOCK.INC
WRAPPER.CLW
WRAPPER.CLW
wslprop.int
xmlclass.inc
xmlclass.inc
XMLExchange.clw
XMLExchange.clw
XMLNameMap.CLW
XMLNameMap.CLW
XMLNavigator.clw
XMLNavigator.clw
XMLSchema.clw
XMLSchema.clw
XMLTreeJoin.clw
XMLTreeJoin.clw
XMLType.inc
XMLType.inc